Lotus Domino ทำหน้าที่เป็น Server คอยรองรับการทำงานร่วมกับแอปพลิเคชันต่าง ๆ บน Notes Client และงานภายในได้อย่างครบถ้วนแทบทุก ๆ ด้าน Lotus Domino จะคอยจัดเก็บข้อมูลและคอยเปิด Services การทำงานต่าง ๆ ในระหว่างที่ผู้ใช้กำลังใช้งาน Lotus Notes อยู่ นอกจากนี้ Lotus Domino สามารถทำหน้าที่เป็น Application Server เพื่อใช้งานแอปพลิเคชันบน Lotus Notes หรือเป็น Web Server ได้ พร้อมทั้งยังมีระบบฐานข้อมูลที่สร้างขึ้นในรูปแบบ NSF อีกด้วย นับตั้งแต่ที่ Lotus Notes R7 ได้ปล่อยออกมา ทำให้ Domino Server สามารถใช้ระบบ IBM DB2 (ระบบควบคุมและจัดเก็บข้อมูลบนฐานข้อมูล) เพื่อเป็นฐานข้อมูลส่วนหลังได้

 Lotus Domino Server ให้บริการ Services ต่าง ๆ ได้หลากหลาย โดยมีหน้าที่หลักประกอบไปด้วยดังนี้
  - Email Server (สนับสนุนการใช้งาน Lotus Notes เพื่อรับส่งอีเมล โดยใช้ POP3, IMAP, Web Browser และ Outlook Client อีกทั้งสามารถส่งอีเมลผ่าน SMTP ได้)
  - Application Server (ใช้โปรแกรมต่าง ๆ บน Lotus Notes Client )
  - Web Server (ข้อมูลบน Lotus Notes สามารถแสดงผ่านทางเว็บเบราว์เซอร์ได้)
  - Database Server (ทำหน้าที่จัดเก็บพื้นที่การใช้งาน Lotus Notes)
  - Directory Server (LDAP) นอกจากนี้ยังมีฟีเจอร์ที่เพิ่มเติมเข้ามาใน Lotus Domino Server ดังต่อไปนี้
  - Data Integration (LEI) - Instant Messaging และ Web Conferencing (IBM Sametime)
  - Domino Document Manager
  - Domino Quickplace (หรือ Lotus Quickr ในปัจจุบัน)
  - Mobile Application Server (Domino Everyplace)
  - Mobile "Push" Synchronization ผ่านอุปกรณ์มือถือ Mail, Calendar, Contacts, Tasks (Lotus Notes Traveler)

 ปัจจุบัน Lotus Domino 9.x ได้ให้ความสำคัญกับสิ่งแวดล้อมมากยิ่งขึ้น ด้วยฟีเจอร์ที่จะเข้ามาช่วยลดการใช้พลังงานและทรัพยากรที่มีอยู่อย่างจำกัด โดยฟีเจอร์ใหม่นี้ จะเป็นกุญแจที่จะไขประตูพาราไปสู่ทางออกของธุรกิจท่านได้ในวันนี้
  - DAOS (Domino Attachments and Object Service) ที่จะช่วยเข้ามาบีบอัดไฟล์ฐานข้อมูล ซึ่งจะช่วยประหยัดพื้นที่ดิสก์ได้มากถึง 40-60% เพื่อที่จะลดการใช้พลักงานของดิสก์ และประหยัดค่าใช้จ่ายด้าน Hardware ได้มากทีเดียว
  - DCT (Domino Configuration Tuner) ลดการทำงานของผู้ดูแลระบบ DCT จะช่วยสแกนหาปัญหาและข้อผิดพลาดที่อาจจะเกิดขึ้นในอนาคตได้
  - ID Vault and Notes Shared Login ช่วยให้ผู้ใช้งานสามารถ Reset รหัสผ่านได้ด้วยตัวเอง และช่วยซิงค์รหัสผ่านในการล็อกอินร่วมกับ Windows ได้